[SadAngel]

Hich, скорее всего какой-нибудь компонент системы находится у тебя в битых секторах. Точнее сектора могут даже считыватся и не определятся как битые. А вот время отклика при этом большое.
Попробуй потестировать жесткий диск утилитой mhdd, или спец. утилитами от производителя жесткого диска.
Да и такой вопрос SMART у тебя включен? Тот же mhdd позволяет просмотреть эти атрибуты. А также подлечить жесткий диск.