Насколько я помню... format disk /s - со слешем и s делает его системным, копирует на него системные файлы.
Могу ошибаться... Проделывал этот трюк эдак лет 5 назад.
Если совсем никак - пиши... Мне в принципе есть где проверить
p.s. где disk имя первичного (основного) диска винта ноутера (о как завернул)... =) Тебе надо будет кстати format.com где-нибудь откопать для этого процесса. А разбить на диски можешь Партишенном или чем нравится.