[net_nika]

сам вентилятор у кулера не жёстко сидит на валу, а имеет небольшой ход вверх-вниз. когда включаете, он в течении нескольких секунд "разгоняется" на подвеске. возможно крыльчатка разболтана. тогда только замена.
P.S. да, и что за кулер? заводской или сторонний производитель? если есть прямой доступ к вентилятору, на открытом системнике во время запуска как только начинает шуметь очень легонько надавите на центральную часть вентилятора. если есть биение, то вы это поймете.